Detección y caracterización molecular de astrovirus y rotativos en niños con gastroenteritis

Abstract

De los virus causantes de gastroenteritis, Astrovirushumano (HAstV) se asocia con diarrea moderada o aguda en 5% de los casos en niños. Los genotipos de HAstV reportados a nivel mundial son los genotipos clásicos (HAstV-1). Por otro lado, Rotavirus se asocia al 30-50% de los casos de gastroenteritis severa y a 453,000 muertes anuales a nivel mundial. La mayoría de las infecciones por rotavirus se atribuyen al genotipo G1 P[8], G2P[8], G4P[8], G2P[4] y G9P[8]. Algunos estudios han descrito variaciones genotípicas e intragenotipicas de rotavirus de una temporada a otra o entre distintas zonas geográficas. En el presente trabajo se analizaron 100 muestras de heces de niños con gastroenteritis. De éstas muestras 5 (5/100, 5%) fueron positivas para Astrovirusy 14 (14/100, 14%) para rotavirus. Dos de las 5 muestras de astrovirus fueron secuenciadas, el análisis de las mismas relaciono a una de las cepas con homología del 98% con genotipo HastV-2 y otra con genotipo HastV-6.De las 14 muestras positivas de rotavirus (6/14, 28.5%) fueron caracterizadas como genotipo G12y 4 (4/14, 28.6%) genotipo P[8]. En el análisis filogenético realizado el gen VP7 genotipo G12 se asoció con el linaje 111, mientras que el gen VP4 genotipo P[8] se relacionó con el linaje V. Así mismo, el análisis de secuencia deducida de aminoácidos demostró variaciones en regiones antigénicas con respecto a las cepas vacúnales (Rotarix® y RotaTeq®). En este trabajo se realizó el primer reporte de cepas de rotavirus G12 en México. Así mismo, en el caso de Astrovirus se detectó la cepa poco común HAstV-6. Estos resultados indican que se requiere de un estudio continuo de epidemiología molecular para determinar la incidencia y variabilidad genética tanto de Rotavirus como Astrovirus. Lo anterior con la finalidad de determinar si las estrategias de prevención actuales son eficientes, como lo es en el caso de rotavirus, o si se requiere que se establezcan nuevas estrategias de prevención y manejo de casos clínicos para gastroenteritis viral.