Estructura del genoma mitocondrial del bagre yaqui (Ictalurus pricei) en el noroeste de México

Abstract

El bagre Yaqui (Ictalurus pricei) es una especie de interés acuícola y amenazada de extinción por causas antropogénicas. La información disponible para la especie evidencia que su estudio y conservación también deben sustentarse en análisis integrales de sus relaciones filogenéticas. El presente trabajo determino la secuencia nucleotidica completa y estructura del genoma mitocondrial de I. pricei, para proporcionar información sobre su origen y relaciones filogenéticas. El genoma mitocondrial completo se obtuvo de dos haplotipos geográficos de I. pricei, uno del Rio Yaqui y otro del Rio Fuerte en Chihuahua, a partir de la técnica "primer walking". Cada genoma mostro una longitud de 16,503 pb con el mismo arreglo que la mayoría de vertebrados, compuesto por una región control, 13 genes codificadores para proteínas, 2 ARNr's y 22 ARNt's. Los contenidos de A+T de estos genomas fue similar entre ambos haplotipos y con la especie hermana, el bagre de canal, I. punctatus. Los codones de inicio y terminacion resultaron conservados en el género /ctalurus. La estructura secundaria de los ARNt's se determinó en ambos haplotipos de I. pricei evidenciando diferencias en dos de ellos. Quince de estos ARNt's fueron conservados respecto a los de I. punctatus. Como estructura de la región control se detectaron las secuencias encargadas de la replicación y transcripción de este genoma, además de la secuencia putativa del origen de replicación de la cadena ligera en la región WANCY flanqueada por ND2 y CO/. El análisis filogenético realizado bajo los criterios de distancias genéticas, máxima parsimonia y máxima verosimilitud mostraron topologías y soporte de nodos consistentes para nuestro grupo de interés colocando a los haplotipos de I. pricei en un clado con I. punctatus reafirmando la monofilia del género y de la familia Ictaluridae. Este clado se agrupo con el bagre armado de China Cranoglanis bouderius de la familia Cranoglanididae. Adicionalmente se detectó la cercanía del clado Ictaluridae + Cranoglanididae con la familia Pangasidae al interior de los Siluriformes.