Secuenciación y estructura del genoma mitocondrial del bagre de Sinaloa Ictalarus sp. (Siluriformes: Ictaluridae) en el noroeste de México

Abstract

Los bagres son un grupo de peces dulceacuícolas muy diversos que ocupan uno de los primeros lugares entre la diversidad de los vertebrados. Nuestro país es considerado el centro de especiación del genera Ictalurus, de donde se ha logrado identificar al bagre de Sinaloa como una nueva especie del complejo de bagres nativos en base a estudios morfológicos y evidencia molecular. La información obtenida en este estudio sobre la estructura genética y el análisis de sus relaciones filogenéticas son buenos argumentos para afirmar que es una nueva especie. El objetivo del presente trabajo es determinar la estructura y secuenciación del genoma mitocondrial del Bagre de Sinaloa Jctalurus sp. para conocer su origen y relaciones filogenéticas. Se obtuvo el genoma mitocondrial completo de dos haplotipos geográficos, uno del río San Lorenzo y otro del río Culiacán. La longitud de los genomas fue de 16,503 pb presentando el mismo arreglo genético que la mayoría de los vertebrados, presenta una Región Control, 13 genes codificadores para proteínas, 2 unidades ribosomales y 22 ARN 's de transferencia. Los dos haplotipos presentan un contenido nucleótido de A-T muy similar y se encontró que los codones de inicio y terminación son conservados en el género Jctalurus. Se determine también la estructura secundaria de los ARNt's de ambos haplotipos mostrando algunas diferencias, el resto presentan una estructura conservada con respecto a los de Jctalurus punctatus. Dentro de la región control se lograron detectar las secuencias encargadas de la replicación, además de la secuencia putativa del origen de la replicación de la cadena ligera en la región WANCY. El análisis filogenético realizado bajo los criterios de distancias genéticas, máxima parsimonia y máxima verosimilitud mostró una topología de nodos consistente para nuestro grupo de interés, colocando a los haplotipos del Bagre de Sinaloa en un clado junto con I punctatus, reafirmando así la monofilia que presenta el género y la familia Ictaluridae, agrupandose muy cercano también con su bagre hermano Cranoglanis bouderius de la familia Cranoglanididae. Nuestros resultados sugieren que bagre de Sinaloa de las cuencas de los rios Culiacán y San Lorenzo puede considerarse como una nueva especie que requiere su descripción formal.